ЦКП

Общие сведения

Центр коллективного пользования «Современные методы экспериментальной биофизики»

Центр коллективного пользования научным оборудованием «Современные методы экспериментальной биофизики» образован на базе научно-исследовательских подразделений Федерального государственного бюджетного учреждения науки Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии Российской академии наук (ЦТП ФХФ РАН) в 2021 году.

ЦКП «Современные методы экспериментальной биофизики» проводит исследования и оказывает услуги в области системной биологии, математической биофизики, регуляции гемостаза и тромбоза, внутриклеточной сигнализации, регуляции митоза, самоорганизации сложных систем.

Основные направления деятельности ЦКП «Современные методы экспериментальной биофизики»:
• проведение научных исследований в области системной биологии, математической биофизики, регуляции гемостаза и тромбоза, внутриклеточной сигнализации, регуляции митоза, самоорганизации сложных систем;
• обеспечение учебного процесса и научно-исследовательских работ в подразделениях ЦТП ФХФ РАН;
• реализация государственных программ и перспективных инновационных проектов.

Руководитель: к.б.н. Подоплелова Надежда Александровна

Основные публикации руководителя:

Anna Tashchilova, Nadezhda Podoplelova, Alexey Sulimov, Danil Kutov, Ivan Ilin, Mikhail Panteleev, Khidmet Shikhaliev, Svetlana Medvedeva, Nadezhda Novichikhina, Andrey Potapov, Vladimir Sulimov. New Blood Coagulation Factor XIIa Inhibitors: Molecular Modeling, Synthesis, and Experimental Confirmation. Molecules. 2022. 27(4), 1234. 10.3390/molecules27041234
Н. П. Новичихина, З. Э. Ашрафова, И. В. Леденева, Н. А. Подоплелова, М. А. Пантелеев, Х. С. Шихалиев. Синтез и антикоагулянтная активность новых функционально замещенных 4Н-пирроло[3,2,1-ij]хинолин-2-онов. Журнал органической химии. 2022. 58(9):965-974. 10.31857/S0514749222090051
Н. П. Новичихина,З. Э. Ашрафова, Н. В. Столповская, И. В. Леденева, М. Г. Холявка, Н. А. Подоплелова, М. А. Пантелеев, Х. С. Шихалиев. Синтез и свойства новых гибридных молекул, содержащих фрагменты 4H-пирроло[3,2,1-ĳ]хинолин-2-она и тиазола. Известия Академии наук. Серия химическая. 2022. №9, 1969-1975.
Ilin I, Podoplelova N, Sulimov AV, Kutov D, Tashchilova A, Panteleev M, Shikhaliev K, Krysin M, Stolpovskaya N, Potapov A, Sulimov V. Experimentally Validated Novel Factor XIIa Inhibitors Identified by Docking and Quantum Chemical Post-Processing. Molecular Informatics. 2022. . 10.1002/minf.202200205
L V Yurina, A D Vasilyeva, L A Vasserman, N A Podoplelova, M A Panteleev, M A Rosenfeld . Effect of Hypochlorite- and Peroxide-Induced Oxidation of Fibrinogen on the Fibrin Structure. Dokl Biochem Biophys. 2021. 499(1):242-246. 10.1134/S1607672921040189

Оборудование

Перечень оборудования ЦКП «Современные методы экспериментальной биофизики»:

• Микроскоп Zeiss Axio Observer Z1 с конфокальным модулем CSU-X1M 5000
Производитель: Carl Zeiss
Год выпуска: 2011
Назначение и основные характеристики: конфокальный микроскоп на основе диска Нипкова является незаменимым инструментом для визуализации быстро протекающих процессов внутри живых клеток. В отличие от сканирующей лазерной конфокальной микроскопии, конфокальный микроскоп на основе диска Нипкова позволяет достичь высоких скоростей сканирования с приемлемым контрастом и минимальной фототоксичностью в обмен на определённую потерю в разрешении и необходимость использования тонких (~10мкм) препаратов. Прибор может быть использован для: высокоскоростной съёмки динамических процессов в клетках долговременной съёмки с минимальной фототоксичностью приложений, где важна чувствительность и скорость в обмен на разрешение

• Анализатор Тромбодинамики Т2
Производитель: HemaCore
Год выпуска: 2019
Назначение и основные характеристики: анализатор Тромбодинамики Т2 предназначен для диагностики нарушений системы свертывания крови путем исследования в гетерогенной системе in vitro пространственно-временной динамики свертывания крови, инициированной локализованным активатором свертывания в условиях, близких к условиям свертывания крови in vivo

• Анализатор Тромбодинамики 4D
Производитель: HemaCore
Год выпуска: 2018
Назначение и основные характеристики: анализатор тромбодинамики 4D предназначен для регистрации и анализа пространственно-временной динамики образования тромбина одновременно с пространственно-временной динамикой образования фибринового сгустка.

• Экструдер с нагревательным блоком Mini-Extruder
Производитель: Avanti Polar Lipids
Год выпуска: 2013
Назначение и основные характеристики: мини-экструдер предназначен для приготовления искусственных однослойных липидных везикул методом экструзии через поликарбонатные мембраны

• pH -метр стационарный FE20-Kit
Производитель: Mettler Toledo
Год выпуска: 2013
Назначение и основные характеристики: стационарный экономичный рН-метр для измерений в лабораторных условиях

• Термостат твердотельный с таймером ТТ-2-"Термит"
Производитель: ДНК-Технология
Год выпуска: 2013
Назначение и основные характеристики: Твердотельный термостат для научных и клинико-диагностических исследований. Рассчитан на использование пробирок типа «Эппендорф» объемом 1,5 и 0,5 мл

Сведения о календарной загрузке научного оборудования в 2022 году

План работы ЦКП в 2023 году

Методики

Перечень методик, используемых ЦКП «Современные методы экспериментальной биофизики»:

1. Световая и флуоресцентная микроскопия
2. Изучение клеточной жизнеспособности и пролиферации с помощью флуоресцентных зондов (Аннексин V, DiOC6, Пропидия йодид, Zombie Violet)
3. Анализ локализации и распределения флуоресцентно-меченных красителей в биологических препаратах (как живых, так и фиксированных клетках и тканях)
4. Исследование динамики проникновения и выведения флуоресцентно-меченных соединений в биологических препаратах (клетки, ткани), в том числе в реальном времени
5. Конъюгирование белков (в том числе антител) с низкомолекулярными флуоресцентными красителями (FITC, Alexa488, Alexa647 и т.д.)
6. Исследование динамики изменения концентрации внутриклеточного Ca2+ с использованием флуоресцентны зондов (Fura Red, Fura-2, Calcium green, Calbryte 590)
7. Исследование и характеризация функционального состояния митохондрий в невозбудимых клетках с применением Rhod-2 и TMRM.
8. Иммунофлуоресцентное окрашивание мазков крови
9. Исследование свертывания крови методом «Тромбодинамика»
10. Исследование пространственной генерации тромбина методом «Тромбодинамика 4D»
11. Гомогенный тест генерации тромбина

Услуги

Перечень работ/услуг, выполняемых в ЦКП «Современные методы экспериментальной биофизики»:

1. Подготовка и анализ биологического материала с помощью лазерной конфокальной микроскопии (от 3000 руб./час)
2. Конъюгирование белков (в том числе антител) с низкомолекулярными флуоресцентными красителями (по запросу)
3. Исследование свертывания крови методом «Тромбодинамика» (от 2000 руб/образец)
4. Исследование пространственной генерации тромбина методом «Тромбодинамика 4D» (от 4000 руб/образец)
5. Гомогенный тест генерации тромбина (от 1500 руб./образец)

Порядок определения стоимости нетиповых услуг

Контактная информация

Адрес: 109029, г. Москва, ул. Средняя Калитниковская, д. 30
Телефон: +7 (965) 218-60-05
E-mail: podoplelova.nadezhda@ctppcp.ru

ЦКП

Общие сведения

Оборудование

Методики

Услуги

Документы

Заявки на выполнение работ

Договоры

Контактная информация